Kwa sababu ya ukali wao wa kipekee, pilipili ni sehemu muhimu ya vyakula vingi duniani kote, hasa katika Kichina (hasa katika vyakula vya Sichuanese), Mexican, Thai, Indian, na vyakula vingine vingi vya Amerika Kusini na Asia ya Mashariki.
Maganda ya pilipili ni matunda ya mimea. Inapotumiwa safi, mara nyingi huandaliwa na kuliwa kama mboga. Maganda yote yanaweza kukaushwa na kisha kusagwa au kusagwa kuwa unga wa pilipili ambao hutumiwa kama viungo au kitoweo.

Pilipili inaweza kukaushwa ili kuongeza muda wa maisha yao ya rafu. Pilipili za Chili pia zinaweza kuhifadhiwa kwa kusafishwa, kutumbukiza maganda kwenye mafuta, au kwa kuokota.
Pilipili mbichi nyingi kama vile poblano zina ngozi ngumu ya nje ambayo haiharibiki wakati wa kupika. Pilipilipili hutumiwa wakati mwingine nzima au vipande vikubwa, kwa kuchomwa, au njia zingine za kupasuka au kuchoma ngozi, ili nyama isiipike kabisa. Inapopozwa, ngozi kawaida huteleza kwa urahisi.
Pilipili mbichi au zilizokaushwa mara nyingi hutumiwa kutengeneza mchuzi moto, kitoweo cha umajimaji - ambacho huwekwa kwenye chupa kinapouzwa - ambacho huongeza viungo kwenye sahani zingine. Michuzi moto hupatikana katika vyakula vingi ikiwa ni pamoja na harissa kutoka Afrika Kaskazini, mafuta ya pilipili kutoka Uchina (inayojulikana kama rāyu nchini Japani), na sriracha kutoka Thailand. Pilipili zilizokaushwa pia hutumiwa kutia mafuta ya kupikia.
Pilipili yetu ya asili isiyolipishwa na dawa ya kuua wadudu yenye ZERO additive sasa inauzwa sana katika nchi na wilaya ambazo zinapenda kuitumia wakati wa kupika. Vyeti vya BRC, ISO, HACCP, HALAL na KOSHER vinapatikana.